Riziko malárie existuje v celé zemi mimo městské části a kromě městských a pobřežních oblastí poloostrovní Malajsie včetně ostrova Pinang. Riziko existuje v hornatém vnitrozemí trojúhelníku sdíleného státy Kelantan, Pahang a Perak (Cameron vysočiny).
Ostrov Borneo:
Sarawak: Přímořské a městské oblasti jsou bez rizika.
Sabah: Riziko existuje v městských a venkovských oblastech po celý rok. P.F. 80% v Sabah.
Multilékovýrezistentní P. falciparum existuje ve všech malarický oblastech.
Výskyt malárie v nižších nadmořských výškách než je 1700 m.
Dominující období výskytu: leden-prosinec
A. balabacensis balabacensis: Komáři v hornatých lesnatých oblastech; líhnou se v malých vodách ve stínu, v kalužích ve zvířecích stopách a v mělkých loužích. Napadají člověka v noci; přebývají venku.
A. sundaicus: Komáři v pobřežních oblastech; líhnou se v poloslané vodě, v lagunách se slunečním svitem, v močálech a mokřinách. Napadají člověka a dobytek uvnitř příbytku; přebývají v domech a úkrytech.
Incidence malárie způsobené parazitem Plasmodium falciparum (nejnebezpečnější forma malárie pro člověka): 65% a incidence malárie způsobené ostatními třemi parazity (Plasmodium vivax, ovale a malariae); benigní forma malárie: 35%
Profylaxe:
U cestovatelů při organizované cestě, ubytování v hotelu, se nepožaduje žádná antimalarická profylaxe, je možné zvážit pohotovostní léčbu (mefloquin, atovaquon/proguanil nebo artemether/lumefantrin) v rizikových oblastech jako je Sabah, Sarawak a západní Malajsie, celoročně.
Ostatním cestovatelům v případě vysokého rizika malárie se doporučuje antimalarická profylaxe (mefloquin, atovaquon/proguanil nebo doxycyklin). V případě průměrného rizika je možné zvážit buď antimalarickou profylaxi (mefloquin, atovaquon/proguanil nebo doxycyklin) nebo jen antimalarika pro pohotovostní léčbu (mefloquin, atovaquon/proguanil nebo artemether/lumefantrin) bez předešlé antimalarické profylaxe. Stejná pohotovostní léčba je vhodná i v případě nízkého rizika expozice malárie.