Riziko malárie se na většině území nevyskytuje, riziko existuje pouze v jižní příhraniční oblasti s Afghánistánem (Khatlon). Ohniska přenosu byla také hlášena z centrálních oblastí (Dushanbe), v západních oblastech (Gorno Badakhshan) a severních oblastech (Leninabad) země. Průměrné riziko: jižní nížiny (příhraniční oblasti s Afganistánem), 70% případů v regionech: Khatlon Oblast, Bokhar, Piange, Kurgan-Turbe a Vaksh nízké riziko: sporadicky v centrálních nížinách, na západě a severu (Leninabad); žádné riziko: v zimě a ve výše položených oblastech.
Dominující období výskytu: červen-říjen
A. maculipennis: Komáři na úpatí; líhnou se v pomale tekoucích potocích, v čité vodě vystavené slunečnímu svitu. Napadají člověka a zvířata; přebývají ve stájích.
A. sacharovi: Komáři ve vnitrozemí a pobřežních močálech; líhnou se ve sladké nebo poloslané vodě v mokřinách, v umělých vodních kolektorech. Napadají člověka a dobytek uvnitř obydlí; přebývají v lidských obydlí a stájích.
Incidence malárie způsobené parazitem Plasmodium falciparum (nejnebezpečnější forma malárie pro člověka): 9% a incidence malárie způsobené ostatními třemi parazity (Plasmodium vivax, ovale a malariae); benigní forma malárie: 91%
Malárie vyvolaná P.falciparum je rezistentní k léčbě s chloroquinem a sulfadoxin-pyrimethaminem se objevuje ve všech malarických oblastech této země.
Profylaxe:
U cestovatelů při organizované cestě, ubytování v hotelu, se nepožaduje žádná antimalarická profylaxe ani pohotovostní (stand-by) léčba.
U ostatních cestovatelů v případě průměrného rizika je možné zvážit buď antimalarickou profylaxi (chloroquin) a při expozici malárie užívat navíc ještě antimalarika pro pohotovostní léčbu (mefloquin, atovaquon/proguanil nebo artemether/lumefantrin), nebo jen antimalarika pro pohotovostní léčbu (mefloquin, atovaquon/proguanil nebo artemether/lumefantrin) bez předešlé antimalarické profylaxe. Stejná pohotovostní léčba je vhodná i v případě nízkého rizika expozice malárie.